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Sophie Schbath

@sophieschbath

Researcher at INRAE MaIAGE lab #statistics #bioinformatics, scientific head of MIGALE bioinformatics facility, concerned about environmental impacts of our activites

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Latest posts by Sophie Schbath @sophieschbath

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We are #hiring a CDD for a 6 ans period on Ingénieur-e développement front-end de systèmes d’information, starting 2026-05-04. Application to Valentin Loux et Sophie Schbath, migale-codir@inrae.fr by 2026-04-13.

More information at maiage.inrae.fr/node/3529.

03.03.2026 07:45 👍 1 🔁 1 💬 0 📌 0
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Axelle Arquié, économiste : « Une catastrophe sociale causée par l’IA fait partie des scénarios possibles » Selon la cofondatrice de l’Observatoire des emplois menacés et émergents, les responsables politiques et les économistes sous-estiment les risques que l’intelligence artificielle fait peser sur le tra...

"Selon la cofondatrice de l’Observatoire des emplois menacés et émergents, les responsables politiques et les économistes sous-estiment les risques que l’intelligence artificielle fait peser sur le travail et sur la démocratie."

www.lemonde.fr/idees/articl...

03.03.2026 12:01 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0
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Le nouveau cahier d'activités Women Do Science de CASIO est disponible !

Des activités, des anecdotes et des portraits de femmes scientifiques pour aider les élèves à se projeter dans des parcours scientifiques.
J'ai mis tout mon petit cœur dans ma partie 🧬⬇️
www.casio-education.fr/actualites/m...

02.03.2026 09:42 👍 16 🔁 11 💬 1 📌 0
La conférence de presse se déroulera au Collège de France, 11, place Marcelin Berthelot, 75005 à Paris, de 16h à 18h30, avec accès à partir de 15h30. Elle est ouverte au public mais les questions seront réservées aux journalistes. Elle comprendra des interventions sur la situation de l’Université et de la recherche aux Etats-Unis et en France :

Yasmine Belkaid, Directrice générale de l’Institut Pasteur  
Michel Feher, philosophe et co-fondateur de la maison d'édition ZoneBooks
Julien Gossa, chercheur au Laboratoire Sociétés, acteurs, gouvernement en Europe, Université de Strasbourg
Valérie Masson-Delmotte, chercheuse au Laboratoire des sciences du climat et de l'environnement, CEA
Nonna Mayer, chercheuse au Centre d'études européennes et de politique comparée,  Sciences Po

La conférence de presse se déroulera au Collège de France, 11, place Marcelin Berthelot, 75005 à Paris, de 16h à 18h30, avec accès à partir de 15h30. Elle est ouverte au public mais les questions seront réservées aux journalistes. Elle comprendra des interventions sur la situation de l’Université et de la recherche aux Etats-Unis et en France : Yasmine Belkaid, Directrice générale de l’Institut Pasteur Michel Feher, philosophe et co-fondateur de la maison d'édition ZoneBooks Julien Gossa, chercheur au Laboratoire Sociétés, acteurs, gouvernement en Europe, Université de Strasbourg Valérie Masson-Delmotte, chercheuse au Laboratoire des sciences du climat et de l'environnement, CEA Nonna Mayer, chercheuse au Centre d'études européennes et de politique comparée, Sciences Po

📣 Conférence Stand Up for Science
Vendredi 6 mars 2026|16h-18h30|Collège de France

Attaques contre les sciences et l’Université aux États-Unis et en France: comprendre les stratégies, cibles et effets et lancer des les mobilisations à venir en France, en écho à celles prévues aux États-Unis.

02.03.2026 12:33 👍 33 🔁 23 💬 2 📌 0
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Vous avez des données métagénomiques à analyser et vous maîtrisez linux ?
👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas
📅 20-21 mai
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

24.02.2026 09:46 👍 1 🔁 2 💬 0 📌 0
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Vous avez des bases en R et souhaitez vous-même analyser statistiquement vos données RNAseq ?
👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas
📅 18-19 mai
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

22.02.2026 16:26 👍 1 🔁 3 💬 0 📌 0
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MaIAGE recrute !

Un poste permanent d'IR en TAL est ouvert au concours.
Descriptif du poste, contacts et modalités de candidature: jobs.inrae.fr/concours/con...

20.02.2026 13:50 👍 2 🔁 5 💬 0 📌 1
Chargé-e de recherche en modélisation et assimilation de données pour les sciences du vivant CR26-MathNum-3 - Vous exercerez votre activité au sein de l'unité Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE) située dans le centre de Jouy-En-Josas et l'Université Paris Saclay. L'unité comporte quatre équipes de recherche et une plateforme de bioinformatique. Vous rejoindrez l'équipe Dynenvie (9 permanents) qui développe des recherches en modélisation dynamique et en statistique pour les écosystèmes, l'épidémiologie et l'agronomie, avec un intérêt particulier pour les phénomènes dynamiques spatio-temporels intégrant des échelles allant de l'intra-hôte à la métapopulation. Ses travaux méthodologiques se déclinent selon trois axes : la modélisation pour ces phénomènes, le développement de méthodes d'inférence adaptées à l'hétérogénéité et la structure de dépendance des données collectées, et le développement de travaux originaux à l'interface de la modélisation et des statistiques. Vous vous intègrerez tout particulièrement dans les premier et le dernier axes.La construction et l'estimation de paramètres pour des modèles dynamiques complexes, non linéaires de grande dimension, à partir de données expérimentales est un enjeu méthodologique fort, qui nécessite le développement d'une recherche à l'interface entre modélisation mécaniste, statistiques et apprentissage (y compris profond). Vous êtes un.e spécialiste de la modélisation (EDO, EDP, modèles hybrides déterministes/ stochastiques) avec un fort intérêt pour l'analyse, l'estimation et l'intégration de données pour ces modèles. Vous contribuerez au développement de modèles dynamiques et de méthodes d'inférence et d'assimilation adaptées, dans un contexte de données souvent de grande dimension et hétérogènes. Le cadre conceptuel pourra être celui de l'estimation bayésienne, des approches à base de métamodèles (splines, processus gaussiens, réseaux de neurones profonds), combinées avec des résolutions de problèmes inverses ou de filtrage. Vous pourrez aussi contribuer au développement d'approches originales de prétraitement et réduction de données, en vue de leur assimilation dans des modèles. Enfin vous contribuerez à ou piloterez des projets à l'interface dans des domaines d'intérêt pour INRAE comme la microbiologie, l'épidémiologie ou l'agroécologie, en particulier pour participer au développement de jumeaux numériques.Au sein de MaIAGE, vous serez en charge de :- développer des méthodes originales permettant l'analyse, l'estimation et l'intégration de données pour des modèles dynamiques ;- développer les algorithmes associés ;- collaborer avec des chercheurs en modélisation, en science des données et d'autres disciplines (microbiologie, épidémiologie, agroécologie par exemple) ;- suivre et contribuer aux évolutions de l'état de l'art dans votre domaine de spécialité.Le contexte scientifique francilien est très dynamique. Vous prendrez part à cette dynamique, nouant des collaborations pertinentes pour construire votre projet de recherche. Vous développerez votre propre réseau de collaborations, nationales et internationales, nécessaires à votre projet de recherche.A votre arrivée, vous participerez à des projets en cours dans votre équipe, par exemple un projet à l'interface avec la microbiologie ou un autre sur la thématique des jumeaux numériques en collaboration avec Inria. Vous serez force de proposition pour en construire de nouveaux, pertinents pour appuyer vos recherches. Vous développerez vos compétences en assimilation de données en vous investissant dans l'animation scientifique de l'interface entre modélisation et sciences des données dans l'équipe et plus largement dans l'unité.

Un poste de chercheur-e en mathématiques est ouvert dans mon labo @inrae-maiage.bsky.social
📅Date limite de candidature : 5 mars.
📝Profil : Chargé-e de recherche en modélisation et assimilation de données pour les sciences du vivant jobs.inrae.fr/concours/con...

22.02.2026 21:24 👍 1 🔁 3 💬 0 📌 0

⏳ Il ne reste plus que quelques jours pour s'inscrire (clôture des inscriptions le 25/02)

22.02.2026 16:25 👍 1 🔁 3 💬 0 📌 0
Photo d'un rassemblement de fascistes tous habillés en noir et portant une cagoule noire, trois ou quatre d'entre eux portent une banderole blanche marquée d'un "Quentin présent"

Photo d'un rassemblement de fascistes tous habillés en noir et portant une cagoule noire, trois ou quatre d'entre eux portent une banderole blanche marquée d'un "Quentin présent"

Petit Fil autour du slogan Néo-nazi assez peu connu "Présent" qui est fortement mobilisé autour de la mort du néo-nazi Quentin en cette journée de rassemblement de la haine !

21.02.2026 14:20 👍 520 🔁 445 💬 19 📌 50
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#RP_INRAE Une étude menée durant 10 ans sur 9 systèmes de cultures au sein d’unités expérimentales montre que cultiver sans pesticides est faisable techniquement et économiquement, sous certaines conditions.
👉 url.inrae.fr/3MLBa8u

20.02.2026 10:40 👍 77 🔁 60 💬 1 📌 7

We're live-watching the 21st century version of authoritarian propaganda. Facebook, of course, was the pioneer.
doi.org/10.1038/s415...

20th century totalitarians had to do with newspapers, radio, TV.

19.02.2026 19:36 👍 9 🔁 2 💬 0 📌 0
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MetaNetMap: automatic mapping of metabolomic data onto metabolic networks Motivation Metabolic networks represent genome-derived information about the biochemical reactions that cells are capable of performing. Mapping omic data onto these networks is important to refine mo...

📢 New bioRxiv preprint led by Coralie Muller, PhD student in the #META team, co-supervised by @cfrioux.bsky.social and @sylvainprigent.bsky.social
MetaNetMap automates the mapping of metabolomic annotation onto metabolic networks. Give it a try! doi.org/10.64898/202...

07.01.2026 14:33 👍 7 🔁 5 💬 0 📌 0
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Vous codez en R et souhaitez adopter le package #Tidyverse pour manipuler vos données de façon plus poussée ?
👉 Notre cycle de formation vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (78)
📅 30-31 mars 2026.
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

18.02.2026 09:26 👍 5 🔁 5 💬 0 📌 0
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We are #hiring a Thèse for a 3 ans period on Parameter inference for PDE models based on Physics Informed Neural Networks: applications to modelling problems in plant and animal health with destructive measurements., starting
2026-10-01.

More information at maiage.inrae.fr/node/3518.

18.02.2026 07:44 👍 0 🔁 2 💬 0 📌 0
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Vous avez besoin de vous former à #Linux ?
👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas
📅 1er avril 2026
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

18.02.2026 09:30 👍 3 🔁 6 💬 0 📌 0

J'aurai le plaisir d'animer cette formation pour celles et ceux qui souhaitent débuter en R. Il ne reste que 3 places ;)

18.02.2026 09:40 👍 2 🔁 1 💬 0 📌 0

L'illustratrice Isabelle Brourman n'a pas encore de page sur @wikipediafr.bsky.social mais semble admissible : vous pouvez créer sa page à partir des sources disponibles afin de réduire le biais de genre sur #Wikipédia (on est toujours à 20,4% de femmes parmi les biographies). #LSPAFaire

18.02.2026 01:19 👍 11 🔁 5 💬 1 📌 0
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🥚📊 73 % des supermarchés vendent encore des œufs de poules en cage. Il y a 10 ans ils se sont pourtant engagés à retirer de leurs rayons tous les oeufs de poules élevés en cage d’ici… maintenant (début 2026).

🕐 Découvrez l’ensemble des résultats de notre enquête avec Anima 👉 lheuredescomptes.org

18.02.2026 07:01 👍 2 🔁 2 💬 0 📌 0
Logo MERIT SFBI

Logo MERIT SFBI

📌 Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s dans les instituts de recherche, universités, établissements d’enseignement et recherche, secteur associatif ou privé

📎 framaforms.org/enquete-meri...

⏳ temps estimé : 20 minutes
📅 date limite de réponse : 31/03/2026

17.02.2026 08:42 👍 4 🔁 9 💬 0 📌 1
Recherche Data Gouv Alors qu’Isabelle Blanc, fondatrice de Recherche Data Gouv, intègre de nouvelles missions au sein de l’Institut Curie, elle revient sur cette aventure collective...

« Vous n’êtes pas seuls, la donnée de recherche est une aventure collective »

Alors qu’Isabelle Blanc, fondatrice de Recherche Data Gouv, intègre de nouvelles missions au sein de l’Institut Curie, elle revient sur cette aventure collective inaugurée en 2022

recherche.data.gouv.fr/fr/actualite...

17.02.2026 07:28 👍 3 🔁 4 💬 0 📌 1
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En seulement 3 ans, le fleuve Yangtsé s'est repeuplé Après des décennies de déclin, la vie est revenue dans le Yangtsé. Selon une nouvelle étude, les populations de poissons ont triplé seulement trois ans après l'interdiction de la pêche. Une preuve qu'...

Une bonne nouvelle - et elles sont rares en matière d'environnement ! : la vie est revenue dans le Yangtsé. Selon une nouvelle étude, les populations de poissons ont triplé seulement 3 ans après l'interdiction de la pêche. Une preuve qu'avec des mesures drastiques, la nature peut se réparer. 🐟

16.02.2026 06:46 👍 242 🔁 94 💬 3 📌 1
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Loïc Lepiniec : architecte de la biologie végétale, du génome aux graines Ingénieur agronome devenu biologiste, Loïc Lepiniec est directeur de recherche INRAE, responsable de l’équipe SeedDream au sein de l’Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB – Université Paris-Saclay/INRAE/AgroParisTech). Spécialiste de la biologie des semences et des réseaux de régulation qui gouvernent leur développement, il a contribué à la structuration des sciences du végétal en France. Il a également accompagné la construction du campus Paris-Saclay, de la création des laboratoires d’excellences (LabEx) et leurs communautés, jusqu’aux évolutions institutionnelles récentes.

Loïc Lepiniec : architecte de la biologie végétale, du génome aux graines

15.02.2026 16:29 👍 9 🔁 2 💬 2 📌 0
Affiche mauve du prochain Salon culture et jeux mathématiques :
Sur le thème Égalités
Du 21 au 24 mai 2026
Place Saint-Sulpice à Paris
On y voit une spirale sur un échiquier

Affiche mauve du prochain Salon culture et jeux mathématiques : Sur le thème Égalités Du 21 au 24 mai 2026 Place Saint-Sulpice à Paris On y voit une spirale sur un échiquier

Salon culture et jeux mathématiques :
Sur le thème Égalités
Du 21 au 24 mai 2026
Place Saint-Sulpice à Paris

15.02.2026 21:45 👍 4 🔁 1 💬 0 📌 0
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Quelle place pour le photovoltaïque en France ? La décarbonation de notre économie passera en grande partie par l’électrification et les énergies renouvelables. Or le solaire photovoltaïque offre plusieurs avantages : faibles coûts, production déce...

La décarbonation de l'économie passera en grande partie par l’électrification et les énergies renouvelables. Or le solaire photovoltaïque, qui offre plusieurs avantages, doit être accompagné dans son essor.

#CNRSénergie 🔋
lejournal.cnrs.fr/articles/que...

13.02.2026 15:52 👍 18 🔁 8 💬 1 📌 1
Avis de décès Pierre Capy Nous venons d’apprendre avec une immense tristesse le décès de Pierre Capy, survenu le 3 février. Pierre était un généticien, spécialiste de la drosophile et de l’évolution du génome. Ses recherches portaient sur la génétique moléculaire des éléments transposables, leur dynamique évolutive, et leurs transferts horizontaux. Pierre débuta sa carrière à l’Université Paris Sud, où il obtint un doctorat en 1982. Il rejoignit ensuite le CNRS comme attaché de recherche. En 1987, il soutint une thèse d’État sur la variabilité génétique des populations naturelles de Drosophiles, sous la direction de Jean R. David, avant d’effectuer un postdoctorat aux États-Unis dans le laboratoire de Dan Hartl, où il étudia l’évolution moléculaire des éléments transposables, une thématique sur laquelle il fonda une équipe de recherche à son retour en France. Il devint professeur à l’Université Paris-Sud (Paris-Saclay) en 2001, où il enseigna la biologie évolutive et la génomique des éléments transposables. Son héritage scientifique est remarquable, il signa plus d’une centaine d’articles dans les meilleures revues du domaine, il encadra onze doctorants, et fut un acteur majeur dans l’essor de la génétique des éléments transposables en France. Il était également très impliqué dans l’administration de la vie scientifique à l’échelle locale et nationale ; il a été responsable du GDR « éléments transposables », président de la section 29 du comité national du CNRS, président du département de biologie à l’Université, et directeur de l’école doctorale SDSV. Il fut également directeur du laboratoire LEGS (actuel EGCE), et un des fondateurs en 2016 de l’institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant (IDEEV).

Triste nouvelle www.ideev.universite-paris-saclay.fr/news/2026/02...

13.02.2026 17:19 👍 1 🔁 1 💬 0 📌 0
La science n'est pas une opinion : l'Académie des sciences réaffirme ses valeurs | Académie des sciences La science n'est pas une opinion : l'Académie des sciences réaffirme ses valeurs

Ce communiqué de l'Académie des sciences est susceptible de vous intéresser.

www.academie-sciences.fr/la-science-n...

14.02.2026 07:57 👍 39 🔁 21 💬 4 📌 0
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Opinion | A.I. Companies Are Eating Higher Education

"La poursuite effrénée de l'IA générative n'a pas seulement nui à l'éducation des jeunes, fondement du progrès futur, elle a également considérablement entravé le soutien à la mise en place de systèmes susceptibles d'aider les étudiants à devenir plus intelligents."
www.nytimes.com/2026/02/12/o...

13.02.2026 06:25 👍 2 🔁 2 💬 0 📌 0
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Ambassadrices de l’ingénierie L’ingénierie, chasse gardée des hommes ? Pour démentir les stéréotypes de genre associés aux métiers de l’ingénierie, une exposition photographique met en avant douze portraits d’« ingénieuses ». Auta...

📸 L’ingénierie, chasse gardée des hommes ? Pour démentir les stéréotypes de genre associés aux métiers de l’ingénierie, une exposition photographique met en avant douze portraits d’« ingénieuses ». #FemmesEnScience

11.02.2026 13:29 👍 32 🔁 14 💬 0 📌 1
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🌺‪ @inrae-france.bsky.social et ses partenaires lancent la 5e édition du « Printemps de la Donnée », du 24 mars au 26 juin 2026, afin de mettre en avant diverses manifestations locales autour de la donnée de la recherche.
🌸 En attendant, proposez vos événements
printempsdeladonnee.fr/contribuer/p...

11.02.2026 15:49 👍 2 🔁 3 💬 0 📌 0